实验室

卵巢癌研究（OCR）小组由Viola Heinzelmann-Schwarz和Francis Jacob领导，提供一个专注于高通量单细胞分析、计算生物学和体外模型的博士职位，用于研究卵巢癌。该项目旨在剖析与同源重组缺乏症相关的肿瘤微环境中的转录程序，特别强调异构体解析、长读长的单细胞转录组学。

职责

成功的候选人将有机会利用先进的长读长单细胞RNA测序技术（PacBio），并应用计算方法探索人类癌症组织样本中的全长转录组。该项目将涉及大规模高通量数据集的统计分析，并为进一步提升计算和分析专业知识提供了强大机会。

进行湿实验室（30%）和干实验室（70%）的研究活动

进行组织处理，包括质量控制，用于文库制备和单细胞RNA测序

应用并进一步开发计算工具以分析和可视化长读长测序数据

进行和分析体外培养实验，以测试和验证细胞类型特异性同工型

参与本科和硕士学生项目

愿意在本合作项目中进行海外科研访问（计算分析与空间蛋白质组学用于免疫细胞亚型及异构体定位）

支持准备资助申请书、科学报告及同行评审出版物

相关资源包括使用巴塞尔卵巢生物样本库、先进的测序平台、高性能科学计算（SciCore+）、多重免疫荧光以及体外药物反应平台（DRUGSENS）。该项目建立在一个紧密的协作环境中，与国际项目合作伙伴、瑞士肿瘤剖析学联盟、DBM生物信息与信息技术部门以及DBM显微镜设施的合作伙伴保持密切合作。

申请资格

候选人应具备扎实的计算分析背景，并对长读长测序技术有浓厚兴趣。需要具备出色的团队合作和英语沟通能力。博士候选人应积极参与项目的塑造和领导，得到资

生物信息学/计算生物学、（生物）物理学、生物科学、系统生物学、分子生物学或相关领域的硕士学位。

湿实验室工作经验，包括细胞培养工作。

数据集分析的统计方法经验。

强烈的国际研究环境工作动力。

对编程语言（如R或Python）有扎实经验。

出色的沟通能力和科学好奇心

此外：单细胞技术分析经验

申请 方式

请将申请寄交给 francis.jacob@usb.ch 并提交以下材料：

A）求职信，B）完整的简历，C）博士申请表（D）至少两位推荐人推荐人。

在线咨询专业老师