1. 确定文章框架

在论文写作开始前，基于研究内容和结论，首先要确定论文的大纲。通俗的说，就是如何科学的讲好一个“故事”。这就需要根据现有结果确定好“故事”的主次和支撑的科学原理。在这里推荐使用思维导图的方法（可借助Process on等思维导图软件），通过将现有的研究内容、结论及理论模型可视化，既能帮助整理研究框架，又方便与导师或合作伙伴共同探讨，在讨论中修改逐渐完善论文的框架结构。

这一过程中，根据研究方向和内容，对于论文要投稿的期刊我们要做到心中有数。因为不同的期刊的论文的侧重点和篇幅的构成不同。很多主流期刊篇幅一般较短，图表一般为3-5部分，有些期刊如Nature及其子刊系列的论文可分区块展开。而有些期刊如Physical Review B期刊对于论文篇幅并不做限制，相对来说比较灵活。在论文写作前可以先初步按照某一期刊的基本形式和布局来构架论文。定好基本的重心和框架后，首先要做的就是根据既定框架进行数据的处理和展示。

2. 数据图表处理

在进行数据的整合和加工前，我们可初步确定论文的图表个数和顺序。上一小节我们已经提到可以根据合适的投稿期刊的惯例及论文的重心进行初步的安排。在此基础之上，可以根据论文的重心和框架对数据进行进一步的筛选和精加工，如图3展示了一些论文中常见的数据图表。在绘制论文图表的过程中有很多注意事项，在这里仅列举几条以供参考：

1）同一个样本的数据在不同图表中尽量保证颜色前后一致；

2）同一图表中的数据尽量避免交叉，可以将原数据整体进行平移并注明；

3）选择颜色进行数据区分的过程中，在满足区分度的基础上尽量选择适合出版和印刷的颜色，避免使用过浅或奇怪的颜色；

总之，研究数据或模型的展示时刻服务于研究内容和结论的展开，需要做到内容精炼又充分，格局工整合理。在此基础上，也可以通过一些3D的模型达到画龙点睛的作用，这里不再赘述。

3. 研究内容及结果

在基本完成数据图表的处理后，就开始着手进行研究内容的撰写。这一部分主要包含研究具体如何开展，数据及模型的结果及其演变和影响因素分析等。在这一部分中需要结合图表将研究内容的具体细节说明清楚，突出研究的创新性和突破性。

4. 讨论与分析

描述清楚研究内容和结果后，更重要的是对其科学的讨论与分析，这是整篇论文的核心所在，也是论文的科学性最好的体现，是文章的重中之重。讨论和分析这一部分主展开方法有很多种，这里提供两种常见的思路：

1）纵向展开，即针对研究的结果，对可能存在的模型或物理机制展开解释，提出论文的论点，然后通过严谨的理论计算和分析来支撑讨论的论点。

2）横向展开，通过对比多年来同一或相似的科学问题他人的几种经典结论，突出研究结果的异常点和创新点，再展开讨论可能的科学依据。

5. 结论

在讨论分析结束之后，就可以书写结论部分来高度概括研究内容的结果、科学原理及重大意义。一般结论只有短短的一小段，因此要在前面的研究内容及讨论与分析的基础上做到高度概括。

6. 引言

引言的写作顺序比较靠后的原因是我们在介绍研究背景、动机及意义时，需要根据论文的结论有侧重点的进行介绍，有的放矢，因此我们需要完善研究内容及结论后再来写会更加的贴合论文的主题。

7. 引言、摘要、标题、关键词

引言的写作顺序比较靠后的原因是我们在介绍研究背景、动机及意义时，需要根据论文的结论有侧重点的进行介绍，有的放矢，因此我们需要完善研究内容及结论后再来写会更加的贴合论文的主题。摘要在写作时可以看成是属于浓缩的引言，因此放在引言之后写会比较好。标题在选择时需要突出研究的特别及科学性。而对于关键词，一般要选用具有丰富科学性的短语。在文章的主体写作完成后，在需要引用他人的研究观点的位置必须给出出处，因此需要插入参考文献。

8. 方法、补充材料及参考文献

一般论文的主体完成后根据需要还要撰写方法及补充材料，这样整篇文章才算正在的完成。顾名思义，方法就是对实验或计算方法的详细说明；补充材料就是对于正文内容的补充，其格式和篇幅一般比较灵活。原则上对于正文的论证有帮助的材料和数据都可以放入补充材料，比如研究方法具体如何开展，同一现象在更多样品中的复现，理论计算的细节以及分析论证中科学机制更多的对比都可以放在补充材料里面。一般情况下，补充材料越充分会尽可能多的解决审稿人的疑问，从而加快审稿周期，提高审稿效率，但同时要注意可能会出现言多必失的情况。

综上所述，合理的论文写作顺序依次为确定文章框架、数据图表处理、撰写研究内容及结果、讨论与分析、结论、引言、摘要标题和关键词、补充材料及参考文献。合理安排写作的顺序能够极大程度上减少论文写作过程耗费的时间和修改，从而提高论文的写作效率。另外，平时可以通过不同期刊的官方网站所给出的“Guideline”，对常用期刊的撰写要求和篇幅安排做到“心中有丘壑”，这样论文写作过程也会更高效。

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