日本国立精神及神经中心是六家国立医学研究中心之一，拥有两个研究所（神经研究所和精神保健研究所）及一家附属医院。

九州大学是日本原 7 个帝国大学之一，目前已成为日本着名的国立大学，在日本以及世界上均占有一定的地位。

在北海道地区已经建立起，以旭川医科大学为中心，连接50余家地方医院的远程医疗网络，极大地解决了日本北海道地区医疗资源不均衡和偏远地区居民就医难的问题。

拥有一般病床位713个，精神病床位49个，结核病床位14个，感染病床位2个，日平均接待患者数632人次。2009年4月拥有医生468名，护士710名，此外还有346名技术和管理人员。

京都大学医学部附属病院下设内科、呼吸器外科、循环器科、小儿科、精神科、神经内科、外科、整形外科、形成外科、脑神经外科等。

日本圣路加国际医院是基督教系的综合医院，成立于1902年，是日本医疗史上第一所现代化医院。